qPCR法检测端粒长度的具体步骤如下:
1、DNA抽提
使用血液、口腔拭子或细胞样本,通过商业化DNA抽提试剂盒(如TIANamp Genomic DNA Kit)提取基因组DNA,洗脱体积通常为50μL TE缓冲液。要求DNA纯度A260/A280≈1.8,浓度标化为15-20ng/μL。
2、qPCR反应体系配制
在冰上配制反应液,以20μL体系为例:
HieffTM qPCR SYBR® Green MasterMix:5μL
端粒引物(10μM):0.2μL
单拷贝基因引物(10μM):0.2μL
模板DNA:2μL
补足至10μL的RNase Free dH2O
3、qPCR扩增程序
基线设置:内参基线设为6-12个循环,端粒基线设为3-7个循环。
阈值设置:内参CT值定为17±1,端粒CT值定为12±1。
使用ABI 7500等定量PCR仪运行程序,需设置阴性对照(无模板)和标准品对照。
4、数据分析
计算端粒信号(T)与单拷贝基因信号(S)的比值(T/S),该比值与端粒相对长度成正比。若需绝对定量,需与已知端粒长度的参考样本比较。
注意事项:
避免气溶胶污染,使用带滤芯吸头和专用移液器。
预混反应组分以减少孔间误差。
样本需技术重复(建议3次),阴性对照单重复。